第1集云霄飞车
高中生侦探工藤新一被称为“日本警察界的救世主”而响誉全国，他帮助警方解决了很多棘手案件。某日，他和青梅竹马小兰一起去坐云霄飞车时遇到了一起因情生恨凶杀事件，其中，有两名黑衣人引起了工藤的注意，工藤暗中跟踪却被发现，黑衣给他灌下毒药后离开，当被警察发现时，工藤已变成了小孩儿的模样。
老爷：真名不详，淡白色头发胡子，秃顶富豪，身材很肥硕，喜欢高谈阔论。私底下与山崎先生有金钱交易，脚伤是假的。设计在密室杀害了山崎经理，目前已经被捕入狱。
山崎经理：戴眼镜的中年男子。八菱银行总经理，与老爷有秘密交易，后被老爷枪击身亡。
小瞳（仁美）：面目姣好的女子，咖色头发，戴着珍珠项链，背着挎包。体操运动员。在多罗碧加乐园利用云霄飞车杀死了前男友岸田。后被捕入狱。
爱子：小瞳的朋友，岸田现任女友，茶色长发，戴着耳坠。一同前往多罗碧加乐园的玩伴。
岸田：爱子的男友，小瞳前男友，穿着红衬衣的短发男子。因移情别恋，被前女友小瞳利用云霄飞车杀死。
礼子：小瞳、爱子的朋友，戴着大眼镜，脸上有雀斑。一同前往多罗碧加乐园的玩伴。
走私社长：本名不详。秃顶光头，带着墨镜的中年人。走私枪械交易的董事长，跟黑衣组织进行交易。以后也是音信全无。
第2集千金绑架
趁警察不注意工藤逃到阿笠博士那里寻求帮助，这时担心工藤的小兰找也找到这里，为保护小兰安全，工藤隐瞒身份并在情急之下取名江户川柯南，阿笠博士将柯南托付给小兰照顾，回家后他们碰到了急匆匆出门办案的毛利小五郎，听说有黑衣人，柯南也跟着一起去。原来是董事长女儿谷晶子被绑架，在管家承认了自己是犯人且没有同伙后，却再次有人打来威胁电话……
谷董事长：谷晶子的父亲，谷集团的董事长，黑色短发，留有大胡须，住址为弥生镇谷宅。因过多关注事业，忽视女儿，后醒悟做出补偿，陪女儿去澳洲旅行。
谷晶子（10）：谷家千金，咖啡头发，紫色眼眸，梳着可爱的小辫子，非常可爱的女孩。特别喜欢狗，爱犬叫巨无霸。特别想让父亲多陪伴自己。
麻生管家：谷家的管家，戴着眼镜，紫白色头发胡子。因同情大小姐，协助小姐策划了绑架闹剧，险些酿成大祸。
绑匪：绑架谷晶子的绑匪，戴着棒球帽的凶恶男子。在二桥中学为毛利父女等人所擒，被捕入狱。
第3集偶像密室
身体变小后柯南转入帝丹小学，并结识了步美、光彦和元太。某日，明星洋子来到毛利侦探事务所，说总感觉有人暗中监视她，为了更进一步了解真相，毛利一行人来到洋子住处，可开门后居然有具死尸横在门口，期间柯南发现了另一名演员优子的耳环并且还注意到洋子的经纪人山岸神态怪异，洋子、山岸、优子到底谁才是真正的凶手。
冲野洋子（21—22）：地球淑女队四人组之一，茶色马尾辫发型。毛利小五郎崇拜的演艺明星。通过她带出了很多案子。因为案件的关系，与毛利小五郎一家成为好朋友。在作品中的工作是日卖电视台主持人，也出演电影和电视剧，出版过个人音乐专辑。住址某大厦的25层。
山岸荣一：冲野洋子的经纪人，黑发苦瓜脸男子。曾经多次出场，帮助洋子进行各种活动。
池泽优子（20）：冲野洋子的竞争对手，偶像歌手，深棕色头发，喜欢戴大耳环。高傲刁蛮，喜欢抽烟。因为冲野洋子的缘故，工作被抢了，所以怀恨在心，经常打一些无言电话还有送一些恐吓信，性格比较阴险。二线歌星和演员。
藤江明义（22）：洋子的前男友，角红商事工作，宽脸黑发男子。在港南高中上学时曾与洋子有交往，为情自杀身亡。
第4集暗号地图
柯南和伙伴们去美术馆时捡到了一张画有奇怪符号的纸，大家自行成立少年侦探团去调查这些暗号，按照符号的指示先到达东京塔，在周围展开侦查却一无所获，休息的时候步美的新发现为柯南找到破解暗号的出口，大家一路寻找从东京铁塔到南部水族馆的标记，然而，事情并非那样顺利，柯南能破解暗号吗？暗中跟踪少年侦探团的黑衣人又是谁？
帝诺卡巴那：意大利强盗，来日本取枫叶金币，被警方逮捕，只好留下藏宝图给同伙。
川奈：强盗三人组老大，戴着墨镜，尖嘴猴腮小胡子的黑衣男子。寻找金币下落，利用侦探团在鬼楼找到金币，却意外失手。最后与两个外国同伴一起被捕入狱。
第5集新干线大爆破
小五郎带着小兰等人去京都参朋友的婚礼，在新干线上柯南看见了两名可疑黑衣男子，他利用阿笠博士送他的眼镜窃听到了不得了的事情——这辆新干线上有炸弹并且即将爆炸，眼看黑衣人离开新干线，柯南只能凭自己找到那只装有炸弹的黑皮箱，锁定了炸弹所在的车厢后，柯南对车厢里的四人进行试探，却毫无头绪，关键时刻元太的一句话提醒了他。
上田、下田：分别为棕色长发的长脸瘦男和戴着墨镜的方脸壮男，酷似琴酒和伏特加的打扮。黑衣打扮的两个恐怖分子，企图利用炸弹摧毁列车，被柯南错当成琴酒和伏特加。最终被捕入狱。
电脑炒股男：四个嫌疑人之一，戴着眼镜和金表的年轻男子，一直炒股，曾经痛扁柯南。
美女乙：带着手提电话看报纸的女子，酒红色套装，红褐色披肩发，戴有耳钉。与上田、下田交易人，拿走了炸弹。最后被柯南等人所救，侥幸生还。
老头丙：四个嫌疑人之一，眉毛胡子全白了，光头，戴着随身听。听力不好，装聋作哑，身材魁梧。
内裤变态丁：四个嫌疑人之一，戴着金色眼镜框的中年壮汉，白西服红衬衣，身上都是金首饰，喝着啤酒。一个看上去很强壮的男子，却带着一堆五颜六色的内裤。
第6集情人节
园子和小兰被邀请去皆川家参加情人节派对，柯南悄悄尾随却被发现。皆川的母亲热情招待各位，但皆川却是一副不耐烦的样子，他拒绝了青梅竹马关谷香的巧克力，又对直道和若松冷嘲热讽，状态不佳的他决定外出透气，他的心仪对象好美也一起跟去，突然一声尖叫，皆川倒在了草坪上，到底是谁在情人节制造了惨剧？
直道：米花大学网球社的成员。性子阴沉的胖子，戴着眼镜，喜欢关谷香。在香烟上下毒企图毒死皆川克彦，但并未成功。
关谷香：米花大学网球社的成员。帅气俊秀女子，蓝色牛仔服，褐色短发。喜欢青梅竹马的皆川克彦。
渡边好美：米花大学网球社的成员。大家闺秀气质的女子，白色休闲服短裙，黑色卷发。喜欢皆川克彦。与克彦亲生母亲很像。
皆川克彦（25？）：米花大学医学系学生、网球社社长，铃木园子的仰慕对象。非常跋扈嚣张的帅哥，爱好抽烟。喜欢渡边好美。被其后母毒杀。
皆川太太：皆川克彦之姑姑，30岁左右，黑色束发，穿着和服。儿子是个名叫阿进的小孩。丈夫生意失败破产。后因毒杀皆川克彦被捕入狱。
若松俊秀：毛利兰的追求者。米花大学网球社的成员，有驾照开车。黑发，看上去强壮无比，长得与大猩猩无二。自称是既温柔又强壮还爱流泪的多情种子。拼命追求兰，但是有点二。看到小兰的巧克力，自认为是送给自己的。当看到生气的小兰一拳把钢管打扁，吓得冷汗直流，放弃追求狼狈而逃。
第7集每月礼物
小川医生这两年来不断收到未署名的钱和玩具，实在是不知道来历，于是前往毛利侦探事务所求助。在柯南的提示下小五郎推理出玩具其实是中古品，而小兰也因此开始怀疑起柯南的身份。在前往小川医生工作的医院调查过程中看到柯南翻阅病例的小兰对柯南的怀疑也进一步加深。最终柯南在千钧一发之际成功解救了小川医生的孩子。而柯南也成功化解了小兰的怀疑。
小川荐行：黑色短发男子，米花综合医院的外科医生，5岁的儿子名叫勇太。有一副祖父留下来价值2千万的名画。对方送来牵牛花，花语是“虚幻的恋爱”。
荻野先生：荻野智也的父亲，穿着风衣，戴着眼镜和帽子，宽脸。因为3年前儿子智也的死迁怒于当时负责手术的小川荐行医生，欲绑架杀害其子勇太，最后还是放弃了。
第8集美术馆
城中美术馆冒出中世纪盔甲会自己走路的传闻，引起了小兰浓厚的兴趣打算一探究竟，没想到却意外地发现美术馆在一周后即将关闭。而购买美术馆的购买者真中计划将这里改造成酒店。小兰一行在参观地狱馆的过程中发现真中被钉在墙上，而在回放录像的时候发现竟然是展览的盔甲将真中杀害！但在回放了录影带和勘察现场之后柯南发现了犯人的犯罪手法并找出了真凶。
落合馆长：米花美术馆的老馆长，很长的淡白色胡子和眉毛，秃顶光头。一直细心地守护美术馆。后因杀死真中老板而被捕入狱。
洼田：美术馆的员工，黑发猥琐男子，做事情漫不经心。最终因倒卖美术品而被捕入狱。
饭岛：美术馆的员工，黑色头发，宽脸稍胖。认真工作的年轻人。
真中老板：黑色短发，胖胖的嚣张男子，有一簇胡子。身边经常跟着一个戴眼镜的设计师。购买美术馆后，打算将其改成酒店，但最终被落合馆长用《天罚》所杀。
第9集天下第一夜祭
柯南和小兰在参加天下第一夜祭时碰到了作家世井，他让小兰帮忙拍了几张照片，这时，横沟警官找到世井说他的朋友今竹被杀，大家一起赶往犯罪现场，期间，世井用自己的文稿代替今竹的交给了《文艺时代》的记者，种种迹象表明世井就是凶手，可让人棘手的是此人有不在场证明——相机里那些照片，仔细推敲后柯南发现了其中的破绽。
今竹智：著名作家，戴眼镜的胖子，获得了直本奖。曾经与世井共同连载过《剑勇传说》。后在桶山旅馆被世井宣一枪杀。
世井宣一：皮肤很黑的男子，长脸黑发，浓眉毛。作家，原本是今竹智的合作伙伴。后因枪杀今竹智被捕。
山田记者：胖脸黑发圆眼睛的男子，前来催稿件的文艺时代编辑部记者。
第10集足球选手
某天一个自称是新一女朋友的量子前往毛利侦探事务所，此举引起了小兰极大的反感。其实量子被拜托看护著名足球运动员赤木英雄的弟弟赤木守，而小守竟遭绑架！迫于绑匪的压力量子不敢惊动警察才出此下策。在小兰拜访量子的时候柯南发觉了量子的难言之隐以新一的身份打来了询问电话。在柯南的推理帮助下终于找到被绑架的小守而英雄也在得知弟弟被找到后完美的赢得了比赛。
量子（16）：米花女子高中一年级女生，穿着红巾白衣蓝裙水手服，红褐色漂亮头发的美女。自称是工藤新一女朋友，其实是赤木英雄的女友。
赤木英雄（19）：足球运动员。与好友上村直树一同被称为天才，后来两人一同加入东京SPIRITS队。又帅又有责任心的家伙。女朋友名叫量子，是米花女子高中一年级学生。
赤木守：赤木英雄的弟弟，米花小学3年级学生。黑发，脸上有稍许斑点。
上村直树：足球运动员。黑色寸发，坚毅的长脸。赤木英雄的好友兼搭档。他的小腿是在练习的时候被赤木英雄踢断的，原来以为英雄是故意的，但在球队胜利之后，英雄把胜利送给他。后来两人冰释前嫌。很勤奋刻苦的球员，是努力的天才。
竹田：东京SPIRITS队的队员，曾经多次助攻给赤木英雄，也曾经破门得分。
利贝拉姆斯：超级大阪队的明星球员，大胡子外援。
第11集月光奏鸣曲
毛利小五郎被一个署名为麻生圭二的人邀请来到月影岛，打听之后得知此人十二年前就在贝多芬的《月光》曲中诡异死去，至今岛上还流传着关于钢琴诅咒的流言，因为前任村长就是死在钢琴旁。柯南等人来的当天，正赶上前任村长的法事，突然钢琴声响起，大家冲进琴房后，看到的是资产家川岛先生的尸体。暮目警官到达的当晚，现任村长也被人刺死，身旁还留下了音符的暗号。
柯南注意到这些音符并将其解读，这时，当地的老警察说仓库里有麻生圭二留下来的乐谱，这种重要线索柯南自然不会放过，他和警察一起去找乐谱，而这期间，一直精神怪异的西本上吊死亡，脚下还留有遗书，柯南推断出这是他杀，当在看到麻生圭二留下来的乐谱后，柯南断定出了凶手，他利用变声领结和广播室说出真相。
麻生圭二：黑发短胡子，月影岛的著名钢琴家。12年前全家被烧死，临终留下月光曲谱给儿子成实。龟山勇、川岛英夫、黑岩辰次、西本健四人为凶手。
浅井成实（26）：即麻生成实，麻生圭二的儿子。清秀纤瘦，漂亮美丽，可爱温柔，向往自然。男扮女装的医生兼伪娘。为调查父亲死亡的真相来到月影岛，伺机寻找仇人给父亲报仇。最终得逞所愿，自燃身亡。
龟山勇：大胡子胖脸的男子。倒卖毒品四人组之一。月影岛的原村长，2年前月圆之夜在公民馆心脏病发而亡。
黑岩辰次（56）：光头魁梧的中年男子。倒卖毒品四人组之一。月影岛的现任村长，遭到了许多村民的反对，死于月光事件。
川岛英夫（56）：小胡子长脸中年男子。倒卖毒品四人组之一。月影岛的大富豪企业家，在月光事件中溺死。
西本健（55）：倒卖毒品四人组之一。月影岛上无业流氓，瘦高的男子，刺猬头发。曾经很阔绰，月光事件中被吊死。
清水正人（49）：宽脸的中年男子，肤色略深。月影岛上的渔民代表，参加了村长竞选，并最终当选为新任村长。
黑岩令子（27）：黑岩辰次的女儿，茶色头发，蒙着半边脸，打扮时髦妖艳。总是大喊大叫。
村泽周一（27）：黑岩令子的丈夫，戴着墨镜的长脸男子，头上戴着帽子。音乐爱好者和调音师。在月光事件中被波及受伤，轻微脑震荡。
平田和明（31）：戴着眼镜的宽脸男子。现任村长黑岩的秘书。毒贩，与川岛英夫利用钢琴进行交易，最终被毛利小五郎等人识破，被捕入狱。
腱太：月影岛上的小孩，浅井成实的病人。
山本巡查：月影岛的老警察，戴着眼镜，灰色头发和胡子。大智如愚的人物，负责保管着麻生圭二留下的琴谱。
上役村主任：戴眼镜的男子，告诉毛利等人麻生已死的情况。
第12集少女诱拐
柯南和步美他们一起玩捉迷藏的游戏，步美躲在一辆车的后车厢中，没想到竟然睡着。元太一直都找不到步美，最后柯南终于用无线电和她联络上了步美，但步美却在车的后备箱中发现了一个人头！刚好此时有件连续绑架少女杀人事件，柯南怀疑那辆车的两个男人就是那个事件的歹徒。为了救出步美柯南通过步美的描述利用滑板开始追踪步美。最终柯南成功追上了步美但所谓的连续杀人犯却是误会一场。
绑匪凶手甲乙：绑架并杀害了数名女孩的两个凶犯，最终被擒获入狱。
疑犯甲：穿着白大衣，戴着墨镜的长脸长发男子。错被当成凶手的男子之一，其实是帝丹大学学园祭的演员。
疑犯乙：穿着棕色大衣，戴着墨镜的宽脸短发男子。错被当成凶手的男子之一，其实是帝丹大学学园祭的演员。被柯南用安全帽打破了头。
第13集奇怪寻亲
阿笠博士送给柯南一幅追踪犯人眼镜，柯南本想把发信器粘在小兰身上，却阴错阳差的粘在了来侦探事务所找爸爸的雅美手表上，根据女孩提供的信息柯南在赛马场找到了女孩的爸爸健三，事情本应就此结束，可第二天传来的却是健三的死讯，担心雅美有危险，柯南利用追踪器找到了一个高大的男人并非雅美，从柯南另一个参与此事的侦探口中得知此事并非寻人那么简单，深入调查过程中，又出现了一桩命案。
冲田：叼着烟，戴着眼镜的冷酷男子，褐色长发，酷似琴酒。十亿元抢劫的主谋，抢匪头目，杀死了一名银行保安。因想杀死广田雅美灭口，最终被捕入狱。
广田雅美：自称是广田健三的女儿，实际上是宫野明美假扮的。
广田健三（48）：圆胖脸男子，出租车司机，养着4只猫，喜欢赌马。银行抢劫团伙之一。想要独吞赃款，被广田明袭击吊死。
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