【由于剧情需要，所以会提及动漫里的剧情，绝无抄袭之意】
就在几个月前，墨家巨子看到秦国的第一剑客盖聂，带着一名少年叛逃出秦国之后，他虽然不知道他为什么这么做，不过他也把他邀请到了机关城。
盖聂带那名少年在前往机关城的路上，就一路被秦国的重甲骑兵追杀，帝国甚至还放出了关押在死牢最深处的黑剑士胜七来继续追杀他们。
也因为盖聂的叛逃，身为相国的李斯找到了卫庄，他们私下做了一个交易，李斯让秦军帮卫庄攻破机关城和找到盖聂，而李斯只想得到那个少年，因为他身上被护国法师“月神”隐藏了一个秘密，他一直都很想得到这个秘密。
所以，流沙组织首先派出“无双鬼”前去截杀他们，“无双鬼”死在剑圣的剑下之后，流沙又派出“苍狼王”，一直追到太湖才被盖聂重伤而逃，而盖聂在残月谷一战身受重伤，就被偶遇的西楚项氏一族送到了镜湖医庄让医仙端木蓉帮他治伤。
盖聂的伤刚刚恢复，流沙便又派出了实力最强的“白凤凰”，一直把他们追到机关城外，才停止追踪。
卫庄之所以会与秦军一起来攻打墨家机关城，是因为他想打败剑圣盖聂，他们同样师出鬼谷派隶属同门，他们二人分别修练的是连横与合纵之剑，他们一直都是彼此最强的对手。
为了可以顺利地攻破墨家机关城，李斯还特意让同样精通机关术的公输仇随行，流沙在进入机关城之前，就已经让黑麒麟先行潜入，不但偷出机关城的图纸，还把号称“日当正，屠尽城”这样奇特的**“鸠羽千夜”投到了水中。
当太阳升起，水中的“鸠羽千夜”在阳光的作用下就会发作形成毒气，现在大部分的墨家弟子都已经身中剧毒，早已失去了作战的能力，目前只有几位头领，在医仙端木蓉提前让他们服下了能解百毒的“百草丹”，才能幸免于难没有中毒，还有躲在机关墨核密室中的项氏一族。
目前，在墨家只有高渐离还能支撑着这个大局，以卫庄的实力与他对战也是需要一定的时间才能把他击败，而“苍狼王”刚进入机关城就命丧在高渐离的“水寒剑”下。
这些人当中有三个少年，一个是天明，就盖聂带着叛逃的那名少年，一个是项氏一族的少主项少羽，还有一个就是前燕国的公主高月，他们只有十三四岁，都是这个战争的孤儿，他们与命运对抗的同时也背负着不同的使命。
端木蓉为了不让卫庄和秦军伤害他们，就冒险把他们送进了墨家禁地，那里是历代巨子历练的地方，里面不但机关重重，而且还处处充满了危机。
然而，他们却凭着他们的聪明才智闯过了重重危机，天明得到了墨家的至尊武器“非攻”，而少羽得到了“破阵霸王枪”，高月却得到了那个一直被墨家隐藏着的，本来是属于阴阳家的“幻音宝盒”。
然而，三个少年却在一个叉路上遇到了陷井分开了，少羽走的是王道，高月和天明走的是侠道。
公输仇得到了机关城的图纸，也进入了墨家禁地想把那三个少年抓到手，他在禁地的最深处就遇到了天明和高月，公输仇告诉天明很多关于盖聂的事情，想让天明憎恨盖聂，他让天明到水底打开开关寻找出路时，还想误导他开错开关，幸好天明发现了他的异常，才没有中他的诡计。
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